9788419284617_Howley.Virus de ARN

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CAPÍTULO 21 • Coronavirus del síndrome respiratorio agudo grave de tipo 2

divergentes de las ortólogas codificadas por sus parientes más cercanos, lo que indica una recombinación. El ORF8 del SARS-CoV experi mentó una famosa deleción de 29 nucleótidos, con lo que se dividió en dos marcos de lectura abiertos (ORF, open reading frames ), al prin cipio de la epidemia humana. 261 Un informe exhaustivo del 2017 de un estudio de muestreo de murciélagos realizado por el Instituto de Virología de Wuhan informó sobre SARSr-CoV de murciélagos con genes ORF8 casi idénticos a los del SARS-CoV, mientras que otros virus como el BtCoV/WIV1 estaban más estrechamente relacionados con el SARS-CoV en otras regiones del genoma. 143 El mismo estudio identificó el primer pariente cercano del ORF3b de SARSr-CoV en un murciélago con un genoma diferente del ORF8 del SARS-CoV, lo que indica que múltiples acontecimientos de recombinación produjeron el virus progenitor inmediato del SARS-CoV, que, sin embargo, no se ha identificado en un reservorio natural. Historia evolutiva del SARS-CoV-2 A pesar del intenso muestreo de poblaciones de murciélagos en busca de SARSr-CoV entre el 2003 y el 2019, el linaje del SARS-CoV-2 per maneció en gran medida sin descubrir hasta principios del 2020. El genoma del SARS-CoV-2 se publicó por primera vez en Virological.org el 10 de enero del 2020 y se caracterizó con mayor detalle al mes siguiente. 440 Este estudio también proporcionó la primera compren sión de los orígenes evolutivos del virus pandémico, describiendo un virus, el BtCoV/RaTG13, con aproximadamente un 96% de identidad nucleotídica con el SARS-CoV-2, una similitud comparable a la del SARS-CoV y su pariente conocido más cercano. Una secuencia par cial de la RdRp del BtCoV/RaTG13 fue publicada previamente en el 2016 como un posible nuevo linaje dentro de la especie SARSr-CoV. 103 La muestra que contenía esta secuencia vírica se obtuvo de un mur ciélago del género Rhinolophus affinis en una mina abandonada en la provincia de Yunnan, en el sur de China, la misma región en la que se han identificado los parientes más cercanos del SARS-CoV, aunque más al sur. Estos virus presentan solo entre un 79 y un 80% de iden tidad nucleotídica con el SARS-CoV en todo el genoma y constituyen un nuevo linaje de la especie SARSr-CoV . Desde el descubrimiento inicial del SARS-CoV-2, se han iden tificado muchas otras secuencias genómicas víricas de este linaje en muestras obtenidas previamente ( véase fig. 21-2). Poco después de la caracterización genómica completa del SARS-CoV-2 en febrero del 2020, se identificaron secuencias víricas relacionadas en pangolines incautados en operaciones contra el tráfico de especies en las provin cias chinas meridionales de Guangxi y Guangdong. En particular, una secuencia de un pangolín incautado en la provincia de Guangdong produjo una secuencia genómica completa que presentaba una iden tidad elevada ( > 90%) con el SARS-CoV-2 y una identidad aún mayor con el SARS-CoV-2 en el RBD de la proteína S que con el BtCoV/RaTG13, conservándose los seis residuos críticos para la unión a la ACE2. 192,384,408 A pesar de la aparente asociación de los virus simi lares al SARS-CoV-2 con los pangolines, sigue sin estar claro si estos últimos son un hospedero reservorio o si se infectan incidentalmente durante el tráfico de animales silvestres. En un estudio realizado entre el 2009 y el 2019 en Malasia, se tomaron muestras de más de 300 pan golines que fueron comerciados y no se encontraron pruebas de infec ción por coronavirus. 202 En cambio, se han incautado pangolines con indicios de infección por coronavirus al final de la cadena de tráfico en redes de tráfico en Tailandia y el sur de China; en algunos casos, estos animales han mostrado indicios de enfermedad pulmonar grave, 408 lo que sugiere que, al menos en condiciones de estrés, los pangolines son susceptibles a la enfermedad causada por estos virus.

Cuatro de ellos se distribuyen por Asia Oriental, mientras que el quinto comprende los SARSr-CoV africano y europeo. En particular, tres de los linajes asiáticos pertenecen a subramas dentro de una única rama, incluidos el SARS-CoV y los virus relacionados. Los virus simi lares al SARS-CoV-2 se encuentran en una rama distante y presentan una distancia genética superior al 10% en la RdRp con respecto a los virus similares al SARS-CoV; están a una distancia comparable a la de los virus europeos y africanos, mientras que las posiciones filogenéti cas relativas de los virus de África y Europa y de los virus similares al SARS-CoV-2 siguen siendo algo inciertas. Esto sugiere que la división entre las ramas del SARS-CoV y del SARS-CoV-2 ocurrió hace bas tante tiempo a pesar del uso de un receptor común (la enzima conver tidora de la angiotensina I de tipo 2 [ACE2, angiotensin I-converting enzyme 2 ]), posiblemente hace cerca de 1000 años. 396 El SARS-CoV y el SARS-CoV-2 están mucho más emparentados con diferentes virus que no utilizan la ACE2 que entre sí, lo que sugiere una compleja his toria evolutiva de las proteínas de la espícula (S, spike ) de unión a la ACE2. Curiosamente, el NL63, un alfacoronavirus, también emplea la ACE2 como su receptor, 251 lo que indica que el uso del receptor no siempre es útil para determinar el parentesco de los virus. ORIGEN Y EVOLUCIÓN DEL SARS-CoV Aunque el origen definitivo del SARS-CoV-2 sigue siendo descono cido, el ejemplo histórico del SARS-CoV proporciona un contexto y una orientación valiosos, dado el probable nicho ecológico simi lar que ocupan ambos virus. La epidemia del SARS-CoV comenzó como un conglomerado de casos inusuales de neumonía en la pri mavera del 2003 en Hong Kong, 200,369 y retrospectivamente se deter minó que había comenzado el otoño anterior en Guangdong, en la China continental. 434 Mediante microscopía electrónica (ME) y aná lisis genómicos, se identificó un coronavirus como agente causal de estos brotes. 82.285 Finalmente, se registraron más de 8000 casos y casi 800 muertes por el SARS-CoV en todo el mundo (https://Orf.who. int/publications/m/item/summary-of-probable-sars-cases-with-onset of-illness-from-1-november-2002-to-31-july-2003). Los investigadores de campo determinaron rápidamente que los pequeños mamíferos en los mercados de animales vivos, pero no en las granjas rurales, estaban infectados, lo que sugiere que eran hospederos intermediarios y no un reservorio. 123 En el 2005, se habían identificado virus relacionados con el SARS-CoV en murciélagos del género Rhi nolophus (murciélagos de herradura) en la China continental, 210 lo que los estableció como hospederos reservorios de estos virus. Aunque rápi damente se identificaron numerosos virus con una identidad nucleo tídica superior al 90% en similitud con el SARS-CoV, hasta el 2013 no se aisló un virus de murciélago, el BtCoV/WIV1, capaz de infec tar células humanas a través del receptor ACE2 del SARS-CoV. 102,209 En los años siguientes se aislaron otros virus de este tipo y se cons tató que eran capaces de replicarse en células epiteliales primarias de las vías respiratorias humanas (VRH). 244,246,418,427,437 Más reciente mente, se han identificado docenas de nuevos miembros de la especie SARSr-CoV en murciélagos de herradura chinos, 196 aunque muchos de ellos se caracterizan únicamente a partir de secuencias parciales de la región del ORF1ab que codifica la RdRp. Aunque se han encontrado SARSr-CoV en toda China, los virus más próximos al SARS-CoV se han identificado en la provincia meridional china de Yunnan. El descubrimiento y el análisis genómico de diversos SARSr-CoV en murciélagos ha revelado un papel crítico de la recombinación en la evolución del SARS-CoV. A pesar del aislamiento del BtCoV/WIV1 en el 2013, quedaban sin resolver varios misterios genómicos sobre la historia evolutiva del SARS-CoV. Aunque el BtCoV/WIV1 infecta células humanas a través de la ACE2, el dominio de unión al recep tor (RBD, receptor binding domain ) de su proteína S es distinto al del SARS-CoV, 102,418 y las proteínas accesorias ORF3b y ORF8 (funcio nes putativas descritas más adelante) del SARS-CoV son altamente

Los descubrimientos de otros virus relacionados notificados más tarde en el 2020 y a principios del 2021 han poblado aún más la rama de virus similares al SARS-CoV-2 del árbol filogenético del subgénero Sarbecovirus ( véase fig. 21-2). Mientras que la mayoría de los virus de la rama del SARS-CoV se han identificado en murciélagos del género Rhinolophus sinicus , la rama del SARS-CoV-2 presenta un Copyright © 2024 Wolters Kluwer, Inc. Unauthorized reproduction of the content is prohibited.