9788419284617_Howley.Virus de ARN

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CAPÍTULO 21 • Coronavirus del síndrome respiratorio agudo grave de tipo 2

Betacoronavirus ( véase fig. 21-1B). 62 Este grupo SARSr-CoV era desco nocido antes de la epidemia de SARS-CoV, pero ahora se sabe que incluye al menos varios cientos de virus 143,196 presentes no solo en toda China, sino también en el Sudeste Asiático, 383 Japón, 259 Corea del Sur, 201 Europa 81 y el África subsahariana. 291,396 Evidentemente, los SARSr-CoV no están estrechamente restringidos desde un punto de vista geográ fico, aunque sigue sin estar claro el grado de preocupación para la salud pública proveniente de los diferentes reservorios víricos. Los dos brotes de SARSr-CoV del siglo se han producido en la China continental. Estructura filogenética de los coronavirus relacionados con el síndrome respiratorio agudo grave En el periodo transcurrido desde la aparición del SARS-CoV (que se detalla más adelante), se han descrito docenas de genomas com pletos relacionados y genomas parciales adicionales, en gran parte mediante análisis metagenómicos. Las secuencias del SARSr-CoV se han identificado principalmente en Asia oriental, incluyendo Japón, Corea del Sur, China, Tailandia y Camboya. Según la distri bución geográfica de las especies reservorio, principalmente murcié lagos del género Rhinolophus , estos virus circulan seguramente en otros sitios del Sudeste Asiático. Además, en Europa y África se han identificado coronavirus lejanamente relacionados con el SARS. Su amplia distribución sugiere un origen antiguo de este grupo de virus. En un estudio realizado en el 2021 por Wells y cols . 396 se llevó a cabo un análisis filogenético de la región codificante de la ARN-polimerasa dependiente de ARN (RdRp, RNA-dependent RNA polymerase ) del ORF1ab (descrito en detalle más adelante) y se identificaron cinco linajes distintos dentro de la especie SARSr-CoV (fig. 21-2).

aunque se propaga más rápidamente, a veces a partir de individuos asintomáticos en todo el mundo. Desde su aparición, el SARS-CoV-2 ha causado la mayor y más grave pandemia mundial desde la pandemia de gripe de 1918. Aún no se entiende del todo por qué este virus, simi lar al SARS-CoV, pudo propagarse con mayor facilidad hasta causar la pandemia mundial. Los coronavirus se dividen en cuatro géneros denominados alfa , beta , gamma y delta . Todos los géneros tienen organizaciones genó micas similares (proteínas estructurales y no estructurales, incluidas las proteínas de la replicasa), pero difieren en sus proteínas acceso rias no esenciales, que a menudo están implicadas en la evasión o el antagonismo de las respuestas de las células hospederas. Los HCoV menos patógenos se agrupan en el género Alfacoronavirus (229E, NL63 y virus relacionados) o en el género Betacoronavirus (fig. 21-1B). Este último género se divide a su vez en subgrupos y linajes en función del parentesco filogenético. Estos incluyen el embeco no altamente patógeno o linaje a (OC43, HKU-1), el sarbeco altamente patógeno o linaje b (SARS-CoV, SARS-CoV-2 y coronavirus relacionados con los murciélagos) y el merbeco o linaje c (MERS-CoV y coronavirus rela cionados con los murciélagos) ( véase fig. 21-1B). EVOLUCIÓN DE LOS VIRUS RELACIONADOS CON EL SARS-CoV-2 El descubrimiento del SARS-CoV-2 y la pandemia subsiguiente 439 han puesto la atención en la evolución y los orígenes de este linaje vírico. El SARS-CoV-2 y el SARS-CoV epidémico del 2002-2003 perte necen a la especie SARSr-CoV del subgénero Sarbecovirus del género

FIGURA 21-1 A. Cronología de la detección de coronavirus humanos (HCoV). Los HCoV del resfriado común HCoV-OC43 y HCoV-229E se conocen desde la década de 1960; el HCoV-NL63 y el HCoV-HKU-1 se identificaron en el 2004-2005. El primer HCoV extremadamente patógeno, el SARS-CoV, se identificó en el 2002, el MERS-CoV en el 2012 y el SARS-CoV-2 en el 2019. B. Estructura del genoma de los HCoV. Los HCoV se encuentran en el género Alfavirus y en tres linajes de Betacoronavirus : embeco (linaje a), sarbeco (linaje b) y merbeco (linaje c). Los genomas tienen extremos 5 ′ con capuchón y secuencias líder ( L ). Las barras intergénicas cortas de color marrón claro son secuencias reguladoras de la transcripción (TRS, transcriptional regulatory sequences ), que marcan el sitio de inicio de la transcripción de cada ARN mensajero subgenómico. Todos los coronavirus codifican 16 proteínas no estructurales (nsp) en los marcos de lectura abiertos 1a y 1b en 5 ′ . Los genes que codifican proteínas estructurales están dispuestos en la porción 3 ′ del genoma en el orden spike ( S ), membrana pequeña ( E ), membrana ( M ) y nucleocápside ( N ). Los genes accesorios específicos de cada linaje se encuentran intercalados entre los genes estructurales ( barras marrón oscuro ). El ORF8 del SARS-CoV evolucionó a ORF8a y ORFb, pero permanece como un ORF8 intacto en el SARS-CoV-2 (como se muestra en la figura) (creada por Alejandra Fausto con Biorender.com). Copyright © 2024 Wolters Kluwer, Inc. Unauthorized reproduction of the content is prohibited.